肠道菌群失调是否严重需要看引起了哪些疾病，具体如下：
慢性腹泻：很多慢性腹泻跟肠道菌群失调有关，此时一般不太严重，患者需积极调整肠道菌群。
肝病：肠道菌群失调可能会引起胆汁酸代谢改变、内毒素代谢紊乱等，可能会影响肝功能，严重时出现肝病，此时比较严重。
动脉粥样硬化：肠道菌群失调可能会升高胆固醇水平，大量胆固醇在此沉积，久而久之造成动脉粥样硬化，此时也比较严重。
肠道菌群是指定植在体肠道内并长期与相互依存的细菌群，包括40多个菌属，400到500种菌种，数量达100万亿之多，是细胞的10倍，重量上相当于一个人的肝脏，占健康成人每日排出粪便的1/3到2/5。
肠道菌群是寄生在肠道内的微生物总称，而肠道菌群内对体有益的有双歧杆菌、乳酸杆菌等，能够促进肠道的正常蠕动，还可以帮助肠道吸收营养，维持肠道的正常功能。
肠道内也可能会出现有害菌，比如大肠杆菌、链球菌等，虽然流动性比较大，但是如果在肠道内大量繁殖，可能会引起肠道菌群紊乱，使有益菌受到抑制以后出现肠道功能异常，引起腹胀、腹泻、便秘、腹痛等症状。